受外贸进出口持续下滑影响，深圳港一季度货物吞吐量同比下降两成。但内贸货量占全港总量比重明显上升，西部港区散杂货运输则成为全港最大亮点，其中招商港务散杂货货量逆市上扬增长0.73%，显示出深圳港积极调整业务结构已显初步成效。
市交通局港航管理分局快速统计数据显示，今年一季度深圳港货物吞吐量4061.77万吨，同比下降19.76%，其中外贸货物吞吐量2955.12万吨，下降23.42%;集装箱吞吐量389.21万标箱，下降20.86%。进出港旅客74.48万人次，下降25.48%。靠离港船舶5.93万艘次，下降23.94%，引领船舶5442艘次，下降10%。
港航分局分析指出，一季度深圳港生产形势有几大特点：
一是集装箱吞吐量连续7个月同比下降，全港货物吞吐量和集装箱吞吐量增幅创深圳建港以来的新低。受国际金融危机影响，中国外贸进出口连续5个月出现负增长，以外贸运输为主的深圳港，在其外向型经济腹地面临金融危机、产业转移、周边港口竞争等不利因素影响下，港口生产量迅速下滑。其中3月份集装箱量134.97万标箱，降20.27%，连续7个月同比下降;2月份为95.55万标箱，创深圳港近5年来单月新低。
二是各码头空箱堆放业务增长。由于货源急剧下降，进出口重箱下降较大，码头开始做起“空箱生意”。由于国内的集装箱堆存费比欧美地区便宜很多，许多外国船公司将空箱“漂洋过海”堆放到国内码头。码头公司提供少收或基本不收堆存费的优惠条件，只收码头装卸费。目前空箱已经“霸占”了深圳各码头的堆场和外堆场，有的码头空箱已经堆到7层，据初步了解，全港堆存空箱近100万标箱。
三是国际班轮航线数量连续下降。3月底，全港国际集装箱班轮航线共177条(美洲线51条，欧洲线47条，亚洲线66条，澳洲线4条，非洲线9条)，连续两个季度下降，比历史最高的2008年9月30日205条减少28条。
四是水路客运量明显下降。码头客运量下降的主要原因：一是船公司由于经营成本高涨等原因，多次大幅减少船班，一季度与去年同期相比客运船班数量下降了40.89%，同时船票价格较高，缺乏与公路客运的竞争力;二是受金融危机和营商成本增高的影响，机场周边众多外资企业内迁外移、倒闭关闭，商务旅客容量大幅减少;三是西部通道建成后更加方便了旅客往来香港;四是内地往澳门旅游的政策收紧，使得客源减少;五是深圳开通与台湾直航航班后，大量台籍和访台客人转乘直航航班，不再经水路至香港中转。
五、招商港务和赤湾港航散杂货成为全港最大亮点。占全港散杂货60%的三大散杂货码头(招商港务、赤湾港航港务本部、海星码头)，今年一季度完成散杂货807.17万吨，下降7.86%，明显低于集装箱降幅。其中招商港务散杂货货量逆市上扬，增幅0.73%，赤湾港航港务本部散杂货货量微跌0.41%。一季度全港铁矿石吞吐量252.95万吨，下降10.45%。1月份铁矿石进口少，到2月开始回升，特别是3月份进口量大增，矿船一度排队等候靠泊。主要原因是中国扩大内需和4万亿元投资政策初具成效，受国家扶持钢铁行业政策的刺激，以及国际市场成本价格下降，铁矿石进口需求的大幅攀升。
六、内贸货量占全港总量比重上升。一季度全港内贸货量占全港总量27.76%，比去年同期提高了3.49个百分点。内贸集装箱吞吐量18.10万标箱，下降18.80%，其中招商港务完成17.27万标箱，降22.52%;盐田港区完成内贸集装箱吞吐量0.83万标箱。
