到日本最为方便的交通工具是乘坐飞机。
日本主要的国际机场是成田国际机场和位于大阪近郊的关西国际机场。从这两个机场出发，有很多搭乘方便的飞往日本国内各城市的飞机航班。日本的航空公司——日本航空(JAL)、全日空(ANA)、日本 AIR SYSTEM(JAS)都有连接欧洲、亚洲和美洲各主要城市的庞大的航线网络。另外，世界各国的主要航空公司也有飞往日本各主要城市的飞机航班。
铁路
日本的铁路铁路总长4.7万公里，铁路中的新干线是长距离客运的主要交通手段，也是向外国旅客推荐的主要交通工具。新干线每隔十几分钟就有一班从东京开往国内各主要城市的列车，线路有东京至大阪间的东海道新干线、大阪至博多间的山阳新干线、大宫至盛冈间的东北新干线、大宫至新泻间的上越新干线和福岛至山形间的山形新干线等等。
此外，在日本的主要大城市中，地铁交织如网，遍布各处，较汽车更为迅捷、准时、方便。
日本的列车车票价格除了根据乘坐距离远近而不同之外，乘坐特快列车、快车等种类的列车和乘坐绿色列车(头等列车)、对号入座车、卧车等座席种类有所不同的列车时还要另外增加支付费用。
短途旅客的列车车票可以在各车站的自动售票机购买，而长途列车车票则要到车站内的“绿色窗口”处购买。
公路
高速公路非常发达，以东京至小牧、小牧至西宫、吹田至下关的公路为首，东北纵贯、九州纵贯、北陆中央等都已全线贯通。此外，还有东京内的首都高速、连接各高速公路的外环高速等，每年都有新的高速公路建成。
水运
日本有几家轮船公司开设有从国内主要港口通往俄罗斯、韩国和中国各港口城市的定期航班。尤其是从日本的福冈市和下关市到韩国，有轮渡和高速轮船在通航。
贴士
准备到日本来旅行的外国旅客必须事先在海外的日本旅行社代理店买好"周游券的兑换票"。
外国旅客到了日本以后，要去指定的日本国内换票处(JTB International、日本旅行、近畿日本Tourist、东急观光等的海外办事处以及跟上述这些旅行服务公司有合作关系的当地地方旅行社)，凭事先买好的"周游券的兑换票"，并出示盖有"临时逗留者"印章的护照，换取日本铁路周游券。
