虽然有推测认为这些石垣是在公元前建造的，但熊野猪垣究竟是何时由何人所建一直是一个历史之谜。由此，对为何建造熊野猪垣的猜测也是说法不一。一些学者认为，“猪垣”，顾名思义就是当地人为了保护农田不受野兽的侵袭而建的防护墙;有人却从石垣沿着山势向下建造的端倪中，猜测这是当地族人为了防止神武天皇征服熊野地区而建造的防御工事;甚至有人将传说中秦朝时由中国到日本采丹药而在新宫市登陆的徐福的故事和这些石垣的建造联系到了一起，说他仿照秦始皇修建万里长城在日本也建造一座微缩的长城……但无论哪一种说法至今仍没有严谨的证据证明其可靠性，日本甚至还成立了“熊野列石研究会”来专门研究熊野猪垣的历史。