福田区疾病预防控制中心是按照国家卫生防疫体制改革要求,在撤销原福田区卫生防疫站(创建于1984年)的基础上,新组建实施疾病预防控制与公共卫生技术管理和服务的全额拨款事业单位,2002年10月18日正式挂牌独立运作。主要负责辖区疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、免疫规划管理、疫情及健康相关因素信息管理、健康危害因素监测与控制、实验室检测评价分析、健康教育与健康促进等技术指导与应用研究。